Sinh vật là gì? Các bài báo nghiên cứu khoa học liên quan

Sinh vật là hệ thống sống có cấu trúc tế bào, có khả năng trao đổi chất, sinh trưởng, phản ứng với môi trường, sinh sản và tiến hóa qua thời gian. Chúng bao gồm cả sinh vật đơn bào và đa bào, được phân loại theo đặc điểm di truyền và cấu trúc, phản ánh sự đa dạng sinh học của sự sống trên Trái Đất.

Định nghĩa sinh vật

Sinh vật là một hệ thống sống có tổ chức, có khả năng thực hiện các quá trình sinh học cơ bản bao gồm trao đổi chất, tăng trưởng, sinh sản, phản ứng với kích thích và tiến hóa theo thời gian. Sinh vật có thể là đơn bào hoặc đa bào, tồn tại ở nhiều hình thức khác nhau từ vi sinh vật cho đến các sinh vật phức tạp như động vật có vú và con người.

Đặc điểm xác định một thực thể là sinh vật không chỉ nằm ở hình thái bên ngoài mà chủ yếu ở chức năng bên trong. Sinh vật có khả năng duy trì nội môi (homeostasis), chuyển hóa năng lượng để duy trì sự sống, truyền tải thông tin di truyền qua các thế hệ và thích nghi với môi trường xung quanh thông qua chọn lọc tự nhiên.

Các đặc điểm phổ quát sau đây thường được dùng để phân biệt sinh vật với vật thể vô cơ:

  • Trao đổi chất (metabolism)
  • Phản ứng với kích thích từ môi trường
  • Sinh trưởng và phát triển theo thời gian
  • Sinh sản (vô tính hoặc hữu tính)
  • Tiến hóa và thích nghi di truyền
  • Cấu tạo từ tế bào – đơn vị cơ bản của sự sống

Ví dụ, một virus có thể có vật chất di truyền nhưng không thực hiện được quá trình trao đổi chất hoặc sinh sản độc lập, do đó không được xem là sinh vật theo nhiều định nghĩa truyền thống.

Phân loại sinh vật

Hệ thống phân loại sinh học hiện đại chia sinh vật thành ba lĩnh vực chính (Domains): Vi khuẩn (Bacteria), Vi khuẩn cổ (Archaea), và Sinh vật nhân thực (Eukarya). Mỗi lĩnh vực được phân chia thành các giới (Kingdoms) như động vật, thực vật, nấm, sinh vật nguyên sinh... dựa trên các đặc điểm hình thái, di truyền và sinh hóa.

Phân loại hiện nay dựa chủ yếu vào phân tích chuỗi RNA ribosome nhỏ (16S hoặc 18S rRNA), nhờ đó cung cấp thông tin di truyền ổn định để xác định mối quan hệ tiến hóa giữa các sinh vật. Cơ sở dữ liệu như NCBI Taxonomy là nguồn thông tin phân loại sinh vật được sử dụng phổ biến trong nghiên cứu khoa học.

Sơ đồ cơ bản của ba lĩnh vực sinh vật:

Lĩnh vực Đặc điểm nổi bật Ví dụ
Bacteria Nhân sơ, đơn bào, thành tế bào peptidoglycan Escherichia coli, Bacillus subtilis
Archaea Nhân sơ, sống cực đoan, màng lipid ether Halobacterium, Thermoproteus
Eukarya Nhân thực, có bào quan màng, đa bào hoặc đơn bào Người, thực vật, nấm men

Hệ thống phân loại này phản ánh sự tiến hóa và đa dạng sinh học, cho phép nhà khoa học nghiên cứu mối quan hệ phức tạp giữa các nhóm sinh vật.

Cấu trúc tế bào

Tế bào là đơn vị cơ bản của sự sống. Tất cả sinh vật đều được cấu tạo từ tế bào. Có hai dạng tế bào chính: tế bào nhân sơ (prokaryotic) và tế bào nhân thực (eukaryotic). Nhân sơ là dạng tế bào đơn giản, không có nhân mà vật liệu di truyền phân bố trong bào tương. Nhân thực có cấu trúc phức tạp hơn, với nhân được bao bọc bởi màng nhân và nhiều bào quan chuyên biệt như ti thể, lưới nội chất, bộ máy Golgi.

So sánh giữa hai loại tế bào:

Đặc điểm Tế bào nhân sơ Tế bào nhân thực
Kích thước 1–10 µm 10–100 µm
Nhân Không có màng nhân Có màng nhân rõ ràng
Bào quan có màng Không có Có (ti thể, lưới nội chất...)
Ví dụ Vi khuẩn Động vật, thực vật, nấm

Tham khảo thêm mô tả chi tiết tại Nature Education – Eukaryotic Cells.

Trao đổi chất và năng lượng

Trao đổi chất (metabolism) là tập hợp các phản ứng sinh hóa giúp sinh vật duy trì sự sống. Quá trình này bao gồm hai nhóm phản ứng chính: đồng hóa (anabolism) – tổng hợp phân tử phức tạp từ các đơn vị đơn giản, và dị hóa (catabolism) – phân giải các chất để tạo năng lượng.

Sinh vật thu nhận năng lượng thông qua nhiều con đường khác nhau. Thực vật, tảo và vi khuẩn lam sử dụng ánh sáng mặt trời trong quá trình quang hợp để tổng hợp đường từ CO₂ và nước:

6CO2+6H2O+photonsC6H12O6+6O26CO_2 + 6H_2O + photons \rightarrow C_6H_{12}O_6 + 6O_2

Động vật và nhiều vi sinh vật sử dụng hô hấp hiếu khí để tạo ra năng lượng từ glucose:

C6H12O6+6O26CO2+6H2O+ATPC_6H_{12}O_6 + 6O_2 \rightarrow 6CO_2 + 6H_2O + ATP

ATP (adenosine triphosphate) là phân tử mang năng lượng trung tâm trong sinh học. Nó được tạo ra trong quá trình chuyển hóa và sử dụng cho mọi hoạt động sống như vận chuyển chất, tổng hợp protein, và chuyển động tế bào.

Các con đường trao đổi chất quan trọng có thể tham khảo tại Khan Academy – Biology.

Sinh sản và di truyền

Sinh sản là quá trình sinh vật tạo ra cá thể mới, đảm bảo sự tiếp nối và duy trì loài qua thời gian. Có hai hình thức sinh sản chính: sinh sản vô tính và sinh sản hữu tính. Trong sinh sản vô tính, cá thể mới được tạo ra từ một cá thể mẹ mà không có sự kết hợp vật chất di truyền từ cá thể khác. Ngược lại, sinh sản hữu tính cần sự kết hợp giữa giao tử đực và giao tử cái, tạo ra hậu duệ mang thông tin di truyền từ cả hai.

Thông tin di truyền được lưu trữ dưới dạng DNA (hoặc RNA ở một số virus), mã hóa các đặc tính sinh học của sinh vật. DNA tổ chức thành các nhiễm sắc thể, mỗi gen trong đó quy định một hoặc nhiều đặc điểm hình thái hoặc chức năng sinh lý. Trong quá trình phân bào (nguyên phân và giảm phân), DNA được sao chép và phân phối cho các tế bào con một cách có kiểm soát.

Đặc điểm so sánh hai hình thức sinh sản:

Tiêu chí Sinh sản vô tính Sinh sản hữu tính
Giao tử Không cần Cần thiết
Đa dạng di truyền Thấp Cao
Tốc độ Nhanh Chậm hơn
Ví dụ Vi khuẩn phân đôi, sinh sản chồi ở nấm Động vật có vú, thực vật có hoa

Chi tiết về cơ chế di truyền và phân bào có thể tìm thấy tại Nature Genetics.

Tiến hóa và chọn lọc tự nhiên

Tiến hóa là sự thay đổi tần số alen trong quần thể sinh vật qua các thế hệ. Nó là kết quả của nhiều yếu tố như đột biến, chọn lọc tự nhiên, giao phối ngẫu nhiên và các yếu tố ngẫu nhiên khác như trôi dạt di truyền (genetic drift). Lý thuyết tiến hóa hiện đại, dựa trên di truyền học quần thể, giải thích cách sinh vật thích nghi và hình thành loài mới.

Chọn lọc tự nhiên, một khái niệm do Charles Darwin đề xuất, là quá trình mà trong đó những cá thể có đặc điểm phù hợp hơn với môi trường có xu hướng sống sót và sinh sản nhiều hơn. Qua thời gian, các đặc điểm có lợi tích tụ và trở nên phổ biến trong quần thể.

Các cơ chế tiến hóa chính:

  1. Đột biến gen: tạo ra alen mới
  2. Chọn lọc tự nhiên: chọn lọc alen có lợi
  3. Trôi dạt di truyền: thay đổi tần số gen do ngẫu nhiên
  4. Di nhập gen (gene flow): trao đổi gen giữa quần thể

Thông tin mở rộng về tiến hóa có thể tham khảo tại Nature Scitable.

Ứng dụng của sinh vật trong công nghệ sinh học

Sinh vật, đặc biệt là vi sinh vật, đóng vai trò cốt lõi trong các ứng dụng công nghệ sinh học hiện đại. Các hệ vi sinh vật được sử dụng để sản xuất enzyme, kháng sinh, hormone, vaccine và thực phẩm lên men. Nhiều loài đã được chỉnh sửa gen để tối ưu hóa năng suất hoặc tạo ra các sản phẩm mới.

Các ứng dụng tiêu biểu:

  • Vi khuẩn E. coli: dùng để sản xuất insulin nhờ kỹ thuật DNA tái tổ hợp.
  • Streptomyces spp.: sản sinh kháng sinh tự nhiên như streptomycin và tetracycline.
  • CRISPR-Cas9: công cụ chỉnh sửa gen có nguồn gốc từ hệ thống miễn dịch của vi khuẩn.

Sinh vật cũng được ứng dụng trong xử lý môi trường (bioremediation), sản xuất nhiên liệu sinh học và phát triển vật liệu sinh học mới. Chi tiết tại Nature Biotechnology.

Vai trò sinh thái của sinh vật

Mỗi sinh vật đóng vai trò cụ thể trong hệ sinh thái. Các sinh vật tự dưỡng như thực vật sản xuất chất hữu cơ từ CO₂ thông qua quang hợp, là nguồn năng lượng khởi đầu cho chuỗi thức ăn. Sinh vật tiêu thụ như động vật ăn thực vật hoặc ăn thịt phụ thuộc vào các sinh vật khác để tồn tại. Sinh vật phân giải như vi khuẩn và nấm phân hủy chất hữu cơ, tái chế chất dinh dưỡng trở lại môi trường.

Các vai trò chính trong hệ sinh thái:

  • Sinh vật sản xuất (producers): Thực vật, tảo, vi khuẩn lam
  • Sinh vật tiêu thụ (consumers): Động vật ăn cỏ, ăn thịt, ký sinh
  • Sinh vật phân giải (decomposers): Nấm, vi khuẩn

Ví dụ về chuỗi thức ăn đơn giản:

Thực vật → Côn trùng ăn lá → Ếch → Rắn → Đại bàng

Sự mất cân bằng ở một cấp bậc có thể ảnh hưởng đến toàn bộ hệ sinh thái. Theo Báo cáo của Cơ quan Bảo vệ Môi trường Hoa Kỳ (EPA), bảo vệ đa dạng sinh học là chìa khóa cho sự ổn định hệ sinh thái.

Giới hạn của định nghĩa sinh vật

Dù phần lớn các dạng sống đều phù hợp với định nghĩa sinh vật, một số trường hợp nằm ở ranh giới như virus gây tranh cãi. Virus có vật chất di truyền, tiến hóa và nhân lên được, nhưng không thể tự trao đổi chất hay sinh sản nếu không có vật chủ. Do đó, nhiều nhà sinh học không xem virus là sinh vật sống.

Các hệ thống sinh học tổng hợp (synthetic organisms) và trí tuệ nhân tạo sinh học (bio-AI) cũng thách thức các định nghĩa truyền thống. Việc định nghĩa lại "sự sống" là chủ đề tranh luận trong sinh học lý thuyết, với các câu hỏi như: liệu một hệ thống nhân tạo có thể có "ý thức sống" nếu có cấu trúc chức năng giống sinh vật?

Tài liệu tham khảo

  1. NCBI Taxonomy Browser. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/
  2. Nature Education. "Eukaryotic Cells". https://www.nature.com/scitable/
  3. Khan Academy. "Biology and Biochemistry". https://www.khanacademy.org
  4. Nature Genetics. https://www.nature.com/subjects/genetics
  5. Nature Scitable. "Evolution 101". https://www.nature.com/scitable
  6. Nature Biotechnology. https://www.nature.com/subjects/biotechnology
  7. U.S. Environmental Protection Agency (EPA). "Ecosystem Condition". https://www.epa.gov

Các bài báo, nghiên cứu, công bố khoa học về chủ đề sinh vật:

Giới thiệu mothur: Phần mềm mã nguồn mở, độc lập với nền tảng, được cộng đồng hỗ trợ để mô tả và so sánh các cộng đồng vi sinh vật Dịch bởi AI
Applied and Environmental Microbiology - Tập 75 Số 23 - Trang 7537-7541 - 2009
TÓM TẮT mothur nhắm đến mục tiêu trở thành một gói phần mềm toàn diện cho phép người dùng sử dụng một phần mềm duy nhất để phân tích dữ liệu chuỗi cộng đồng. Phần mềm này xây dựng dựa trên các công cụ trước đó để cung cấp một gói phần mềm linh hoạt và mạnh mẽ cho việc phân tích dữ liệu giải trình tự. Như một nghiên cứu điển hình, chúng tôi đã sử dụng moth...... hiện toàn bộ
Phân Loại Bayesian Điện Biên Để Gán Nhanh Trình Tự rRNA Vào Hệ Thống Phân Loại Vi Khuẩn Mới Dịch bởi AI
Applied and Environmental Microbiology - Tập 73 Số 16 - Trang 5261-5267 - 2007
TÓM TẮT Dự án Cơ Sở Dữ Liệu Ribosome (RDP) với bộ phân loại Bayesian đơn giản có thể nhanh chóng và chính xác phân loại các trình tự 16S rRNA của vi khuẩn vào hệ thống phân loại cấp cao hơn mới được đề xuất trong Bản phác thảo phân loại vi khuẩn của Bergey (Ấn bản thứ 2, phát hành 5.0, Springer-Verlag, New York, ...... hiện toàn bộ
#Bộ phân loại RDP #rRNA 16S #phân loại vi khuẩn #biến V2 và V4 #pyrosequencing #so sánh cộng đồng vi sinh vật #biểu hiện khác biệt giữa các mẫu.
Máy Chủ RAST: Phân Tích Nhanh Sử Dụng Công Nghệ Subsystems Dịch bởi AI
Springer Science and Business Media LLC - Tập 9 - Trang 1-15 - 2008
Số lượng chuỗi gen prokaryote có sẵn đang tăng lên một cách đều đặn và nhanh hơn khả năng của chúng tôi để chú thích chính xác chúng. Chúng tôi mô tả một dịch vụ hoàn toàn tự động để chú thích gen của vi khuẩn và sinh vật cổ. Dịch vụ xác định các gen mã hóa protein, gen rRNA và tRNA, phân công chức năng cho các gen, dự đoán các hệ con nào được đại diện trong bộ gen, sử dụng thông tin này để tái tạ...... hiện toàn bộ
#gen prokaryote #chuỗi gen #chú thích tự động #vi khuẩn #sinh vật cổ #protein #rRNA #tRNA #mạng lưới chuyển hóa.
Phân tích các quần thể vi sinh vật phức tạp bằng phân tích điện di gel gradient biến tính của các gen được khuếch đại bởi phản ứng chuỗi polymerase mã hóa cho 16S rRNA Dịch bởi AI
Applied and Environmental Microbiology - Tập 59 Số 3 - Trang 695-700 - 1993
Chúng tôi mô tả một phương pháp phân tử mới để phân tích đa dạng di truyền của các quần thể vi sinh vật phức tạp. Kỹ thuật này dựa trên việc tách biệt các đoạn gene mã hóa cho 16S rRNA, có cùng chiều dài, được khuếch đại bằng phản ứng chuỗi polymerase (PCR) thông qua điện di gel gradient biến tính (DGGE). Phân tích DGGE của các cộng đồng vi sinh vật khác nhau cho thấy sự hiện diện của tối ...... hiện toàn bộ
Bẫy Mạng Ngoại Bào Neutrophil Tiêu Diệt Vi Khuẩn Dịch bởi AI
American Association for the Advancement of Science (AAAS) - Tập 303 Số 5663 - Trang 1532-1535 - 2004
Neutrophils nuốt và giết vi khuẩn khi các hạt kháng khuẩn của chúng hợp nhất với thể thực bào. Tại đây, chúng tôi mô tả rằng, khi được kích hoạt, neutrophils giải phóng protein hạt và chromatin cùng tạo thành sợi ngoại bào liên kết với vi khuẩn Gram dương và âm. Những bẫy ngoại bào neutrophil (NETs) này phân hủy các yếu tố độc lực và giết chết vi khuẩn. NETs phong phú in vivo trong chứng lỵ thí ng...... hiện toàn bộ
#NETs #bẫy ngoại bào neutrophil #vi khuẩn #viêm cấp tính #vi sinh vật #yếu tố độc lực #kháng khuẩn.
CheckM: đánh giá chất lượng của bộ genome vi sinh vật được phục hồi từ các mẫu cô lập, tế bào đơn lẻ và metagenome Dịch bởi AI
Genome Research - Tập 25 Số 7 - Trang 1043-1055 - 2015
Sự phục hồi quy mô lớn của các bộ genome từ các mẫu cô lập, tế bào đơn lẻ và dữ liệu metagenome đã trở nên khả thi nhờ những tiến bộ trong các phương pháp tính toán và giảm đáng kể chi phí giải trình tự. Mặc dù sự mở rộng này của các bộ genome nháp đang cung cấp thông tin chính yếu về tính đa dạng tiến hóa và chức năng của đời sống vi sinh vật, việc hoàn thiện tất cả các bộ reference genom...... hiện toàn bộ
#genome #CheckM #vi sinh vật #ô nhiễm #hoàn chỉnh #metagenome #tế bào đơn lẻ #phương pháp tự động
Phân tích cộng đồng vi sinh vật với năng suất cực cao trên nền tảng Illumina HiSeq và MiSeq Dịch bởi AI
ISME Journal - Tập 6 Số 8 - Trang 1621-1624 - 2012
Tóm tắt Giải trình tự DNA tiếp tục giảm chi phí, với Illumina HiSeq2000 có thể tạo ra tới 600 Gb dữ liệu đọc cặp 100 nucleotide trong một chu kỳ mười ngày. Trong nghiên cứu này, chúng tôi trình bày một giao thức cho việc giải trình tự amplicon cộng đồng trên các nền tảng HiSeq2000 và MiSeq của Illumina, và áp dụng giao thức này để giải trình tự 24 cộ...... hiện toàn bộ
Phát triển Chiến lược Giải trình Gấp Đôi và Quy trình Chỉnh sửa để Phân tích Dữ liệu Chuỗi Amplicon trên Nền tảng Giải trình MiSeq của Illumina Dịch bởi AI
Applied and Environmental Microbiology - Tập 79 Số 17 - Trang 5112-5120 - 2013
TÓM TẮT Sự tiến bộ nhanh chóng trong công nghệ giải trình đã thay đổi cảnh quan thực nghiệm của sinh thái vi sinh vật. Trong 10 năm qua, lĩnh vực này đã chuyển từ việc giải trình hàng trăm đoạn gen 16S rRNA mỗi nghiên cứu thông qua thư viện nhân bản sang việc giải trình hàng triệu đoạn mỗi nghiên cứu bằng các công nghệ giải trình thế hệ tiếp theo từ 454 v...... hiện toàn bộ
#sinh thái vi sinh vật #giải trình gen #công nghệ giải trình thế hệ tiếp theo #gen 16S rRNA #nền tảng MiSeq #amplicon
Biofilms: Cơ chế sinh tồn của vi sinh vật có liên quan lâm sàng Dịch bởi AI
Clinical Microbiology Reviews - Tập 15 Số 2 - Trang 167-193 - 2002
TÓM TẮTMặc dù màng sinh học (biofilm) lần đầu tiên được mô tả bởi Antonie van Leeuwenhoek, lý thuyết mô tả quá trình hình thành màng sinh học chưa được phát triển cho đến năm 1978. Hiện nay, chúng ta hiểu rằng màng sinh học là phổ quát, xuất hiện trong các hệ thống nước thông thường và công nghiệp, cũng như ở nhiều môi trường và thiết bị y tế có liên quan...... hiện toàn bộ
OrthoMCL: Nhận diện Nhóm Ortholog cho Bộ Gene Sinh vật Nhân thực Dịch bởi AI
Genome Research - Tập 13 Số 9 - Trang 2178-2189 - 2003
Việc nhận diện các nhóm ortholog rất có ích cho việc chú thích bộ gene, nghiên cứu tiến hóa gene/protein, so sánh bộ gene, và nhận diện các chuỗi giới hạn theo phân loại. Tuy nhiên, các phương pháp đã được khai thác thành công cho phân tích bộ gene vi khuẩn lại gặp khó khăn khi áp dụng cho sinh vật nhân thực, do kích thước lớn của các bộ gene này có thể chứa nhiều gene paralog và thông tin...... hiện toàn bộ
#Ortholog #Eukaryotic Genomes #OrthoMCL #Comparative Genomics #Gene Annotation #Markov Cluster Algorithm #Paralog Recognition #Proteome Analysis
Tổng số: 2,162   
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6
  • 10